Alors que les guerres de Kaiju font rage, Pacific Rim : Amara suit la jeune héroïne dont la vie s'est brisée lorsqu'elle est devenue orpheline lors d' ... d'une attaque de monstre dévastatrice. Luttant pour survivre alors que sa ville est détruite, elle trouve refuge auprès d'un méca-inventeur grincheux nommé Kai et de sa plus proche compagne, Hannah. Le trio forme une famille improbable au lendemain de l'invasion, se protégeant l'un l'autre et fouillant les décombres pour trouver de vieilles pièces mécaniques pour construire leur propre Jaeger, un robot géant pilotable capable de protéger Amara des monstres qui lui ont tout pris.