En tant que descendant d'une famille de shinobi, Jirou Azuma a appris des techniques de ninja toute sa vie. En plus de cela, il a aussi la capacité de parler aux animaux. Un jour, il sauve un étrange chat noir nommé Ragou et apprend que le monde est rempli d'esprits appelés Mononoke qui peuvent prendre la forme de personnes et d'animaux. Cependant, leur rencontre est interrompue par un Mononoke hostile qui en a après la puissance de Ragou.
Il y a 200 ans, une guerre planétaire a quasiment anéanti l'espèce humaine. La terre n'est plus peuplée que de machines livrées à elles-mêmes... La jeune Roue est élevée par Zett, un robot pacifique, véritable père de substitution, qui la couvre d'attentions. Leur quotidien est bouleversé par l'arrivée d'un nouveau venu, Chrome. Tout juste activé, il prend le rôle du petit frère naïf et maladroit dans leur étrange famille. Zett tente tant bien que mal de lui faire intégrer la notion d'autonomie... Pas évident pour un robot !Tout s'accélère quand un "fou", un androïde fou, détruit Zett avant d'attaquer Roue. Pour Chrome, l'heure du choix est venue : il devient le protecteur de la fillette ! Il se révèle être un combattant surpuissant et écrase son adversaire. Heureusement, l'unité centrale de leur père adoptif est intacte : il ne reste plus qu'à lui trouver un corps compatible... Mais vers qui se tourner dans ce monde vaste et plein de dangers ?